L'histoire nous emmène juste après les évènements de Queen's Blade. Annelotte est une jeune princesse chevalière qui fut exilée à cause d'une erreur qui l'a impliquée dans une insurrection contre la noblesse de plus en plus corrompue. En voyant que le régime de Claudette, qui est la dirigeante de Gynos et de l'ensemble du continent, impose sa tyrannie par la force, elle décide de mener une rébellion contre cette dernière avec l'aide d'une armée rebelle pour pouvoir renverser ce régime et ainsi rétablir la paix sur le continent.