Selon une ancienne légende, un joyau d’une valeur inestimable aurait été scellé jadis sur le mont Tsurugi. Tandis que Yaiba et ses compagnons poursuivent leurs recherches dans les montagnes, Fûma Kotarô, un redoutable ninja, interrompt soudainement leur progression. Parallèlement, Onimaru ourdit dans l’ombre son projet d’unification, déterminé à étendre son emprise sur l’ensemble du pays.